Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK97

Kcnq4, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 4, mousemouse

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Length 696 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnq4Q9JK97 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Kcnq4Q9JK97 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Kcnq4Q9JK97 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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Kcnq4Q9JK97 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnq4Q9JK97 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms