Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms