Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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OtofQ9ESF1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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OtofQ9ESF1 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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OtofQ9ESF1 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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OtofQ9ESF1 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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OtofQ9ESF1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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OtofQ9ESF1 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
OtofQ9ESF1 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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