Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Usp29Q9ES63 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Usp29Q9ES63 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Usp29Q9ES63 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Usp29Q9ES63 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
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Usp29Q9ES63 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Usp29Q9ES63 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Usp29Q9ES63 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Usp29Q9ES63 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Usp29Q9ES63 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Usp29Q9ES63 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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