Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Clstn1Q9EPL2 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms