Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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