Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Smg9Q9DB90 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Smg9Q9DB90 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Smg9Q9DB90 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
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