Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn22Q9D7U6 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn22Q9D7U6 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn22Q9D7U6 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn22Q9D7U6 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn22Q9D7U6 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn22Q9D7U6 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn22Q9D7U6 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn22Q9D7U6 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn22Q9D7U6 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms