Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tubgcp4Q9D4F8 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tubgcp4Q9D4F8 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tubgcp4Q9D4F8 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tubgcp4Q9D4F8 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms