Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Pramef12Q9D2F1 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Pramef12Q9D2F1 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Pramef12Q9D2F1 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Pramef12Q9D2F1 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Pramef12Q9D2F1 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms