Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nip7Q9CXK8 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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