Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Plec-217ENSMUST00000169438 14827 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Ncapd3-202ENSMUST00000086198 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Kif1b-203ENSMUST00000060537 10233 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 R3hdm2-201ENSMUST00000064793 4175 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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