Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Commd4Q9CQ02 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms