Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg3Q9CPX6 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms