Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms