Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms