Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TrabdQ99JY4 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TrabdQ99JY4 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TrabdQ99JY4 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TrabdQ99JY4 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TrabdQ99JY4 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TrabdQ99JY4 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TrabdQ99JY4 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TrabdQ99JY4 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
TrabdQ99JY4 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
TrabdQ99JY4 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TrabdQ99JY4 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TrabdQ99JY4 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TrabdQ99JY4 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
TrabdQ99JY4 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TrabdQ99JY4 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TrabdQ99JY4 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
TrabdQ99JY4 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TrabdQ99JY4 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TrabdQ99JY4 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TrabdQ99JY4 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TrabdQ99JY4 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TrabdQ99JY4 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
TrabdQ99JY4 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
TrabdQ99JY4 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
TrabdQ99JY4 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
TrabdQ99JY4 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
TrabdQ99JY4 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
TrabdQ99JY4 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
TrabdQ99JY4 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
TrabdQ99JY4 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
TrabdQ99JY4 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
TrabdQ99JY4 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TrabdQ99JY4 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TrabdQ99JY4 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
TrabdQ99JY4 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
TrabdQ99JY4 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TrabdQ99JY4 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TrabdQ99JY4 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TrabdQ99JY4 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TrabdQ99JY4 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TrabdQ99JY4 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TrabdQ99JY4 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
TrabdQ99JY4 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TrabdQ99JY4 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TrabdQ99JY4 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
TrabdQ99JY4 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
TrabdQ99JY4 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
TrabdQ99JY4 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
TrabdQ99JY4 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
TrabdQ99JY4 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
TrabdQ99JY4 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
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