Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms