Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42683-201ENSMUST00000196136 2328 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20281-201ENSMUST00000188225 267 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 4933436E23Rik-201ENSMUST00000192824 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37614-201ENSMUST00000195645 210 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42698-201ENSMUST00000197790 762 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 AC105169.1-201ENSMUST00000218912 1294 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1208-201ENSMUST00000099810 1075 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11827-201ENSMUST00000142297 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn1r-ps47-201ENSMUST00000176694 907 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppargc1bQ8VHJ7 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppargc1bQ8VHJ7 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppargc1bQ8VHJ7 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn1r198-201ENSMUST00000091733 903 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppargc1bQ8VHJ7 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppargc1bQ8VHJ7 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppargc1bQ8VHJ7 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms