Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Srsf4Q8VE97 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms