Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms