Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dnajc28Q8VCE1 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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Dnajc28Q8VCE1 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Dnajc28Q8VCE1 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dnajc28Q8VCE1 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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