Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Vmn1r200Q8R281 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Vmn1r200Q8R281 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Vmn1r200Q8R281 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Vmn1r200Q8R281 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
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Vmn1r200Q8R281 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Vmn1r200Q8R281 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
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Vmn1r200Q8R281 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Vmn1r200Q8R281 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Vmn1r200Q8R281 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Vmn1r200Q8R281 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vmn1r200Q8R281 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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