Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
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Colec12Q8K4Q8 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
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Colec12Q8K4Q8 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Colec12Q8K4Q8 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Colec12Q8K4Q8 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Colec12Q8K4Q8 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Colec12Q8K4Q8 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Colec12Q8K4Q8 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Colec12Q8K4Q8 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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