Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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