Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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