Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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FgbQ8K0E8 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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FgbQ8K0E8 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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FgbQ8K0E8 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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FgbQ8K0E8 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FgbQ8K0E8 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms