Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Znf628Q8CJ78 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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