Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms