Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms