Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Tceal8-201ENSMUST00000060101 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Olfr1107-201ENSMUST00000099865 1109 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 4930402F11Rik-204ENSMUST00000208612 1405 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Olfr726-207ENSMUST00000217319 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Nsun6-204ENSMUST00000114715 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm13566-201ENSMUST00000117428 1142 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm11318-201ENSMUST00000118640 961 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Olfr590-ps1-201ENSMUST00000118801 898 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm11321-201ENSMUST00000121257 902 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm13502-201ENSMUST00000121574 684 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm12082-201ENSMUST00000138164 600 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Mcpt2-201ENSMUST00000015576 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm26024-201ENSMUST00000158657 322 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm26974-202ENSMUST00000183263 930 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm35570-201ENSMUST00000198730 681 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm43472-201ENSMUST00000200175 154 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm43748-201ENSMUST00000202329 1233 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Olfr795-ps1-201ENSMUST00000205245 763 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm45110-201ENSMUST00000205704 1402 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 4933432K03Rik-201ENSMUST00000205739 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm35625-202ENSMUST00000211040 266 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 AC107453.2-201ENSMUST00000227714 655 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Olfr745-201ENSMUST00000062534 1175 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Olfr1504-201ENSMUST00000078282 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Platr22-201ENSMUST00000181274 1617 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm12288-201ENSMUST00000121054 1282 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Astx4d-201ENSMUST00000123136 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm23819-201ENSMUST00000158744 109 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm9890-201ENSMUST00000171867 537 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Astx4a-201ENSMUST00000177683 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Astx4c-201ENSMUST00000178390 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Gm21454-201ENSMUST00000178599 1285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Astx4b-201ENSMUST00000179359 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim35Q8C006 Galntl6-205ENSMUST00000188531 1056 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms