Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z24

Negr1, Neuronal growth regulator 1, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Negr1Q80Z24 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Negr1Q80Z24 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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Negr1Q80Z24 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Negr1Q80Z24 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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Negr1Q80Z24 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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Negr1Q80Z24 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Negr1Q80Z24 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Negr1Q80Z24 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Negr1Q80Z24 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Negr1Q80Z24 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Negr1Q80Z24 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Negr1Q80Z24 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Negr1Q80Z24 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Negr1Q80Z24 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Negr1Q80Z24 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Negr1Q80Z24 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Negr1Q80Z24 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Negr1Q80Z24 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Negr1Q80Z24 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Negr1Q80Z24 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Negr1Q80Z24 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Negr1Q80Z24 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Negr1Q80Z24 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Negr1Q80Z24 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Negr1Q80Z24 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Negr1Q80Z24 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Negr1Q80Z24 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms