Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NischQ80TM9 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NischQ80TM9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NischQ80TM9 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NischQ80TM9 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NischQ80TM9 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NischQ80TM9 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NischQ80TM9 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NischQ80TM9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NischQ80TM9 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NischQ80TM9 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NischQ80TM9 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NischQ80TM9 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NischQ80TM9 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NischQ80TM9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NischQ80TM9 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NischQ80TM9 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NischQ80TM9 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NischQ80TM9 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NischQ80TM9 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NischQ80TM9 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NischQ80TM9 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NischQ80TM9 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NischQ80TM9 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NischQ80TM9 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NischQ80TM9 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NischQ80TM9 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NischQ80TM9 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NischQ80TM9 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NischQ80TM9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NischQ80TM9 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NischQ80TM9 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NischQ80TM9 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NischQ80TM9 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NischQ80TM9 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NischQ80TM9 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NischQ80TM9 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NischQ80TM9 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NischQ80TM9 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NischQ80TM9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NischQ80TM9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NischQ80TM9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NischQ80TM9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NischQ80TM9 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NischQ80TM9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NischQ80TM9 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
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