Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms