Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sys1Q78S06 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms