Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM2

Srsf1, Serine/arginine-rich splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf1Q6PDM2 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Gm26957-201ENSMUST00000182645 977 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf1Q6PDM2 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms