Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms