Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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