Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sdc3Q64519 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms