Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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PtprdQ64487 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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PtprdQ64487 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
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PtprdQ64487 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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PtprdQ64487 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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PtprdQ64487 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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PtprdQ64487 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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PtprdQ64487 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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PtprdQ64487 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
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PtprdQ64487 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprdQ64487 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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