Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

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Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Defa17Q64016 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
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Defa17Q64016 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Defa17Q64016 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Defa17Q64016 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Defa17Q64016 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Defa17Q64016 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Defa17Q64016 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Defa17Q64016 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Defa17Q64016 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Defa17Q64016 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms