Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sall3Q62255 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sall3Q62255 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sall3Q62255 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sall3Q62255 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sall3Q62255 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sall3Q62255 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sall3Q62255 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sall3Q62255 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sall3Q62255 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sall3Q62255 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sall3Q62255 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
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Sall3Q62255 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Sall3Q62255 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Sall3Q62255 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Sall3Q62255 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Sall3Q62255 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Sall3Q62255 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Sall3Q62255 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Sall3Q62255 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Sall3Q62255 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Sall3Q62255 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Sall3Q62255 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms