Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SspnQ62147 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SspnQ62147 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SspnQ62147 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SspnQ62147 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Foxm1-202ENSMUST00000112148 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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