Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cln3Q61124 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms