Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms