Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms