Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Tktl2-202ENSMUST00000183187 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Cspg4-201ENSMUST00000035661 8121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Mlh3-202ENSMUST00000166821 5420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Rhobtb1-201ENSMUST00000020101 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Trappc1Q5NCF2 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms