Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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BB287469Q3UT53 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
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BB287469Q3UT53 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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BB287469Q3UT53 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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BB287469Q3UT53 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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BB287469Q3UT53 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
BB287469Q3UT53 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
BB287469Q3UT53 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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BB287469Q3UT53 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
BB287469Q3UT53 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
BB287469Q3UT53 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
BB287469Q3UT53 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
BB287469Q3UT53 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
BB287469Q3UT53 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
BB287469Q3UT53 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
BB287469Q3UT53 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
BB287469Q3UT53 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
BB287469Q3UT53 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
BB287469Q3UT53 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
BB287469Q3UT53 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
BB287469Q3UT53 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
BB287469Q3UT53 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
BB287469Q3UT53 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
BB287469Q3UT53 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
BB287469Q3UT53 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
BB287469Q3UT53 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
BB287469Q3UT53 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
BB287469Q3UT53 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
BB287469Q3UT53 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
BB287469Q3UT53 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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