Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Gm36495-201ENSMUST00000221201 684 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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