Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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